יום שבת, 24 בנובמבר 2001

מיקרואורגניזמים עתיקים - רפאל איקן

 

החוקר פטש וצוותו מהמכון האוקינוגרפי של וודסהול בארצות הברית, דיווחו לאחרונה על הימצאותם של מיקרואורגניזמים באבן ביטומנית ממדינת קנטאקי שגילה נאמד בכ-365 מיליון שנה. המיקרואורגניזמים ניזונים על פחמן קרוגני. המונח קרוגן, שפירושו מפיק שמן (דלק נוזלי), הוא פולימר פחמני שנוצר מחומר אורגני המצוי בחיידקים ובאצות בתנאים גיאותרמיים נאותים של טמפרטורה, לחץ ותהליכי פולימריזציה. 



יש לציין, שהחוקרים מנסים עתה להשתמש במיקרואורגניזמים אלה לשם פירוק צמיגי גומי משומשים, פולימרים פלסטיים ואף לפירוק אספלט. 2001 ,72.Science News, 159, 198 (2001) 8. p


פורסם ב"כימיה" 57,  בהוצאת מדיום - 2001


יום שישי, 23 בנובמבר 2001

גחלת לוחשת 2001 - צבי עצמון


לקציני חיל הפראים הפולני היו טענות קשות כלפי הצבא הגרמני, על אי הגינות: כיצד זה שולחים מפלצות פלדה מכוערות - טנקים - כנגד סוסיהם האצילים? טענות מעט דומות נשמעו פה ושם גם לאחר מלחמת יום הכיפורים: לנו היו טנקים פאר הטכנולוגיה, אז זה הוגן מצד המצרים לפזר בדיונות חיילי חי״ר פשוטים מצוידים בטילי נ״ט - כך מנהלים מלחמה? 

 ״איך בדיוק קשורות דוגמאות אלו ללוחמה ביולוגית?״ נשאלתי כשהגיעו שורות אלו להגהה מן הדפוס. הנה, עכשיו, נוכח דפי ההגהה, בראיון שמתפרסם ב״ידיעות אחרונות" (19.10.2001) נותן פרופ׳ אריה אלדד, מי שהיה קצין רפואה ראשי, תשובה: "אנחנו חייבים להיות תמיד צעד אחד לפני האיום. בפועל, לא פעם, אנחנו ממשיכים את המלחמות שנגמרו״, 

מלחמת יום הכיפורים גם תרמה לשיח העברי את המושגים ״מחדל״, "סבירות נמוכה" ו״הקונספציה״. ״סבירות נמוכה״ היתה גם בפיהם של מומחים - קבל עם ותקשורת - שעות ספורות לפני שנחתו כאן הסקאדים הראשונים של סדאם. 

סבירות לגבי העתיד - לא רצוי לטעות בהערכתה, אבל אפשר אולי לסלוח על כך. אך מה באשר ל״עד היום לא ידוע על אף מקרה שבו נעשה שימוש בנשק ביולוגי - לא על ידי מדינות, ובוודאי שלא על ידי ארגוני טרור״? - כך פרסם עיתון מכובד בארץ זמן מה לאחר שהמילה ״אנתרקס״ הפכה לחלק מהלקסיקון היומיומי. בראשית 1998 נכתב בגליליאו: ״המקרה הראשון המתועד בהיסטוריה של שימוש מכוון בלוחמה ביולוגית התרחש בשנת 1346, בעת מצור שהטילו הטטארים על עיר הנמל קאפא שלחוף הים השחור״ (ראו בגוף הטקסט). כחמש מאות שנה לאחר מכן, בשנת 1763, ניתנה, כפי הנראה, הוראה מטעם המפקד הבריטי העליון באמריקה, ג׳פרי אמהרסט (Amherst), לחלק שמיכות נגועות בנגיפי אבעבועות־שחורות לאינדיאנים שכיתרו את מבצר פורט פיט (פיצבורג) במערב פנסילבניה. ואף זאת ״במהלך מלחמתם בסין בשנות ה־30 וה-40 של המאה ה־20, פיזרו היפנים [יחידה 731 ללוחמה ביולוגית] פרעושים נושאי דבר בערי סין ומנצ׳וריה, ובעקבות זאת פרצו מגפות״ (ראו בגוף הטקסט). ואני תוהה,  מי שאינו מדייק בפרטי העבר, כיצד יעורר אמינות בהערכות העתיד? באותו עיתון עצמו מתפרסמות הערכות על הקשיים הטכניים שניצבים בפני מי שרוצה לתקוף בנשק ביולוגי,  והמסקנה - אכן, ״סבירות נמוכה״...


נבגים של חיידקי גחלת

וגם זאת מצאנו: ״שר הבריאות, נסים דהאן אמר [...] שישראל ערוכה לכל תרחיש וכי במחסני משרד הבריאות יש מלאי תרופות מספיק לטיפול בחיידק האנתרקס. גורם צבאי בכיר אמר שלישראל כמויות גדולות של תרופות וכי תירגלו את חלוקתן״. ראשית, מעודד שיש מלאי תרופות מספיק. אמנם במחסנים, מחסני החירום, והביטוי הזה - ימ"חים" אולי מזכיר משהו. ובכל זאת מלאי התרופות מעודד, אם אכן הצהרת השר מדוייקת. ב-1995 בפני נציג  גליליאו התחמקו מלהבטיח זאת (גליליאו 13, עמ׳ 9). אבל נדמה לי שב"ישראל ערוכה לכל תרחיש״ נשמעים צלילי שאננות מוכרים היטב מן העבר. כל תרחיש אפשרי?! והרי כל כך הרבה תרחישים התרחשו בעולם ובארץ, רק לאחרונה, מבלי שציפו להם. 

אחד התרחישים הוא חיידקי גחלת (אנתרקס) מהונדסים־גנטית שהם עמידים בפני סוגי אנטיביוטיקה מקובלים.  חשש המדיר שינה מעיניהם של מומחים רבים בתחום, מומחים אמריקאים, אף בימים אלה בהם חיידק הגחלת־אנתרקס בראש החדשות, הוא לוחמה בנגיף האבעבועות־השחורות. מצבו המיוחד של נגיף זה - היותו מושמד־לכאורה, ומצבה החיסוני של האוכלוסיה טעונים סכנה רבה. ודאי שאי אפשר להתכונן לכל תרחיש אפשרי, אך רצוי שלא לפזר הבטחות סרק שאננות, ובד בבד לעשות פעולות ולערוך הכנות מעשיות שיכולות להקטין ככל האפשר את הסיכון. התרעה ניתנה כבר - למזלנו במינון נמוך, בצורה הפחות מאיימת על האוכלוסיה כולה, ולא במקומותינו. אבל ההתרעה ניתנה; תירוץ ההפתעה לא יעמוד הפעם.

ממאמר שפרסם דני שוהם* למדנו את ההשוואה הבאה: טיל 2-V גרמני שנשא 1 טון של חומר־נפץ גרם בלונדון למותם של 5 בני אדם בממוצע ולפציעתם של 13. הסקאדים העירקים גרמו, למרבה המזל, פחות נפגעים בנפש. טיל כימי המכיל 300 ק״ג של גז העצבים סארין יגרום על פי הערכה בין 200 ל־3000 הרוגים (לפי מידת ההגנה של האוכלוסיה) ולעוד כמספר הזה נפגעים. טיל גרעיני בן 20 קילו־טון יגרום ל־20,000 הרוגים וכמספר הזה פצועים. ואילו טיל שנושא בחובו 30 ק״ג (30 ק״ג!) של נבגי גחלת (אנתרקס), על פי הערכה יגרום למותם של 80,000-20,000 בני אדם (תלוי באמצעי ההגנה שיינקטו).

Dany Shoham: The Chemical and Biological Threat to Israel, in: Arieh Stav (Ed.): Ballistic Missiles, The Threat and the Response. Brassey's publishers 1999.


לקריאה נוספת

חיידקי מלחמה - צבי עצמון 

פורסם בכתב העת "גליליאו" 48, נובמבר-דצמבר 2001. 

יום רביעי, 21 בנובמבר 2001

עטיפה פלסטית הקוטלת חרקים - רפאל איקן

 

עטיפה פלסטית הקוטלת חרקים - רפאל איקן

החוקר פול דובסון וצוותו מאוניברסיטת קלמסון שבדרום קרוליינה מייצרים חומרים פלסטיים מחלבונים המצויים בתירס, סויה וחיטה. נוהגים להוסיף גם חומר טבע כמו ניסין (nisin), שהוא בעל תכונות של מדביר מיקרוביאלי. ניסין הוא בקטריוצין בעל תכונות אנטיביוטיות, המופרש על ידי חיידק והמשמש גם בתהליך הפקת יוגורט וגבינה. ניסין אף משמש זה זמן רב כתוסף המונע גידול פתוגנים, במיוחד ליסטריה, הגדלים באתרי קירור. עתה עוסקים החוקרים במציאת טכנולוגיה להחדרת ביופולימרים, המכילים ניסין וחומצה לאורית ליריעות פלסטיק העשויות מפוליאתילן.

ניסין - המבנה הכימי
 Pmblair2, Wikimedia Commons




המקור: 2000, 221 .Science News, Vol. 158. p


פורסם ב"כימיה", 55,  2001



יום שישי, 16 בנובמבר 2001

הפיזיקה של מחלות פריונים - דניאל קרמר


מחלת הפרה המשוגעת היא אחת מקבוצת מחלות ניוון נוירולוגיות הנגרמות בגלל חלבונים משובשים הנקראים פריונים (וראו: רות גביזון ואלברט טרבולוס, "חידת הפריונים", גליליאו 15, ואביב שחק, "מי משוגע?", גליליאו 43). ההתפרצויות האחרונות של מחלת הפרה המשוגעת בעדרי בקר באירופה, והגידול שנגזר מכך כנראה במקרי מחלת קרויצפלד-יעקב בבני אדם, העמידו את הפריונים במוקד פעילות מדעית ענפה לגילוי תכונותיהם, ומציאת דרכי טיפול מתאימות. למרות שהקהילה הרפואית הבינלאומית השיגה התקדמות מרשימה בחקר החלבונים המשובשים, מחקר חדש שפרסמו הפיזיקאים קוקס וסינג (Cox, Singh) מאוניברסיטת קליפורניה בדיוויס, מעיד על כי ניתן להבין את התפתחות המחלות הפריוניות בעזרת מודל פשוט של מכניקה סטטיסטית. החוקרים גילו, בין היתר, כי תוצאות המודל שלהם מתאימות לשכיחות הנמוכה והאחידה של מחלת קרויצפלד-יעקב ברחבי העולם, ולקשר בין תקופת הדגירה לבין מנת הפריונים שחדרו לגוף.

המבנה התלת-ממדי של פריון תקין (מימין) ושל פריון שהשתנה (משמאל).
(התמונה מעבודתם של Huang, Prusiner & Cohen).

באמצעות הדמיה (סימולציה) של הדבקה על סריג דו-ממדי גילו החוקרים כי קומץ של פריונים יכולים לשמש כעין "זרעים" לגידולם של פריונים נוספים על תאי העצב הנגועים. ברגע שאסופת הפריונים גדולה דיה, תהליכים שונים יכולים לפצל את האסופה ולגרום לפריונים לקפוץ אל תאי עצב אחרים, וכך על-ידי זריעת "מושבות" פריונים חדשות המחלה מתפתחת עד למותו של החולה.

המודל אינו מציע רק תיאור קודר של התפתחות מחלה פריונית עד למותו של החולה. החוקרים גילו סימנים מעודדים כאשר הם ניסו לשלב במודל אי-סימטריה בין זני הפריונים. לדוגמה, הפריונים שמדביקים בדרך-כלל תאי-עצב של עכברים יכולים גם לתקוף ביעילות אוגרים, אבל פריונים קטלניים לאוגרים, אינם משפיעים על עכברים. על פי המודל החדש מציעים החוקרים כי הזרקת פריונים לא מזיקים של אוגרים לעכבר נגוע עשויה להוביל לתחרות בין זני הפריונים, אלה של האוגר ואלה של העכבר. תחרות זו יכולה להביא לירידה דרמטית בקצב התקדמות המחלה.

מלחמה זו של פריונים בפריונים, למרות שאינה יכולה להביא למרפא למחלות פריוניות, יכולה להביא למצב בו תקופת הדגירה של המחלה ארוכה מחיי אדם, כך שהמחלה אינה קיימת באופן מעשי.

נוסף על רעיונות חדשים לריפוי המחלות הפריוניות, מודל המבוסס על מכניקה סטטיסטית יכול לעזור בניבוי ההתפתחות של התפרצויות של המחלות, כמו זו שפקדה את אנגליה בסוף שנות התשעים.

פורסם ב"גליליאו"  48, נובמבר-דצמבר 2001.

יום שני, 12 בנובמבר 2001

שיטה חדשה להדברת מיקרואורגניזמים . בפירות ובירקות - רפאל איקן

 

מקובל לחשוב, כי הרתחה עשויה לקטול מיקרואורגניזמים שונים. אולם מתברר כי אין הדבר נכון לגבי מיקרואורגניזמים הנלווים לירקות ולפירות. נמצא כי אף שטיפה יסודית במים אינה גורמת להרחקתם.

מקובל אומנם להשתמש בתמיסת הלבנה מהולה לשם כך, אולם החוקרים מאוניברסיטת ג׳ורג׳יה בארצות הברית מצאו, כי השריית הירקות והפירות במים חומציים שנתקבלו מתמיסת מלת בישול מהולה שנחשפה לאלקטרוליזה - עדיפה מבחינת זמינות ומחיר ומבחינת פעילות משמעותית בהדברת וירוסים וחיידקים. 


ChatGPT


כך, למשל, נמצא כי טבילת 100 מיליון תאים של חיידקים פתוגניים במי ברז רגילים למשך 5 דקות גרמה לירידת הפתוגנים ל- 10,000 תאים בערך. ואילו הטבלת אותה כמות של תאים של חיידקים פתוגניים בתמיסה חומצית של מלת בישול שעברה אלקטרוליזה - הותירה כ-100 תאים בלבד. לדעת החוקרים עדיפה אפוא תמיסה חומצית של מלת בישול על פני מים, שלתוכם הוזרם הגז כלור.

Science News, V0I.158, p. 221,  2000


פורסם ב"כימיה", 55, 2001

יום חמישי, 11 באוקטובר 2001

חיידקים מפרקי פלסטיק - אלכס סיון

 

חיידקי קרקע המסוגלים לפרק פוליאתילן עשויים לסייע בפירוק פסולת פלסטיק

פסולת פלסטיק של פולימרים סינתטיים בעלי משקל מולקולרי גבוה אשר אינם פריקים ביולוגית (Non-bodegradablc) מצטברת בסביבה ומהווה גורם סיכון אקולוגי גובר והולך. המקור העיקרי של פסולת הפלסטיק הוא הפוליאתילן, המשמש בחקלאות האינטנסיבית בעיקר לחיפוי קרקע ולחממות. על פי הערכות המשרד לאיכות הסביבה התצרוכת השנתית של יריעות פוליאתילן היא כ-20,000 טונה. אולם, כמות הפסולת של יריעות הפוליאתילן הממוחזרת מדי שנה היא רק כ-15% מהתצרוכת השנתית. כיום אין שיטות לפירוק יעיל של פוליאתילן, ,לכן הכמות של פסולת הפלסטיק גדלה מדי שנה ומהווה מפגע סביבתי. בהיעדר שיטות פירוק או פינוי מתאימות, שאריות הפוליאתילן נטמנות בקרקע או נשרפות תוך גרימת זיהום אוויר חמור.

לאחרונה בודדו, במעבדת עורכי המחקר מספר חיידקי קרקע, המסוגלים לגדול על פוליאתילן כמקור פחמן יחיד ולגרום לפירוק חלקי של הפולימר. איפיון חיידקים אלה ולימוד מנגנון הפירוק עשויים להוביל לפיתוח שיטה חדשנית וידידותית לסביבה - לפירוק ביולוגי מבוקר של פסולת פוליאתילן.


תמונה 1: ביודגרדציה של פוליאתילן שהודגר במצע סינתטי עם חיידקי קרקע למשך 5 שבועות (א)
בהשוואה לפוליאתילן שהודגר באותו המצע ללא תוספת חיידקים (ב).
החיידקים השתמשו בפוליאתילן כמקור פחמן יחיד, גרמו להתפוררותו ולירידה במשקלו בשיעור של כ-15%.


הפוליאתילן כמזהם סביבתי
בשלושת העשורים האחרונים תפסו מוצרי פלסטיק בלתי מתכלים את מקומם של מוצרים מתכלים רבים בשימוש הביתי, התעשייתי והחקלאי. החדירה של חומרי הפלסטיק לשווקים הללו גרמה לעלייה משמעותית בכמות ובמגוון של מוצרי הפלסטיק בהשואה לחומרים אחרים. הבעיה האקולוגית הכרוכה בשימוש בחומרי פלסטיק נובעת מהנפח הגדול שתופסת פסולת הפלסטיק ומחוסר תהליכי סילוק ופירוק מתאימים. בנוסף לכך, המגמה המתמדת של החלפת חומרים טבעיים (הניתנים לפירוק) בחומרים סינתטיים בתחומי החקלאות והתעשייה גורמת להצטברות מהירה של פסולת פלסטיק בלתי מתכלה בסביבה, ודבר זה מהווה מטרד אקולוגי חמור.


איור 1: גידול חיידקי קרקע במצע מזון המכיל פוליאתילן כמקור פחמן יחיד.


פולימרים סינתטיים פותחו במקורם לחיים ממושכים ולעמידות לכל צורות הדגרדציה (כולל ביודגרדציה), והם בעלי מאפיינים מיוחדים הניתנים לשליטה על ידי שיווי המשקל המולקולרי והפונקציונליות (Swift, 1993). למרות שחלק מחומרי הפלסטיק ממוחזרים וחוזרים לשימוש מחדש ביישומים שונים, לא תמיד המיחזור אפשרי והוא אינו קל לביצוע. בהקשר זה פוליאתילן, בשימושיו השונים, הוא הפלסטיק הבעייתי ביותר. פסולת פוליאתילן, ובייחוד זו שמקורה בחיפוי קרקע בחקלאות, קשה לאיסוף בצורה נקייה משאריות צמחים ,ולהעברה לאתרי המיחזור. בהיעדר שיטות סילוק הולמות, הפוליאתילן משימושים חקלאיים נערם בשולי השדות ונשרף על ידי החקלאי, לרוב באופן עצמאי ולא מבוקר; לכן הוא גורם גם לזיהום אוויר.

הפוליאתילן נחשב לאחד מהפולימרים האינרטיים ביותר והעמידים בפני פירוק מיקרוביאלי. עמידותם של הפולימרים הסינתטיים לביודגרדציה מיוחסת לעובדה שחומרים אלה חדשים יחסית בסביבה. לפיכך, אם אכן קיימות בטבע מערכות אנזימטיות לביודגרדציה של פוליאתילן - הן נדירות ביותר, זאת מכיוון שפירוק מיקרוביאלי של השרשרת האולפינית תלוי בפירוק אנזימטי של קשרי C-C, ואנדואנזים בעל פעילות כזאת נדיר בטבע. לעומת זאת, פירוק ביולוגי של פחמימנים טבעיים, כגון נפט, מתרחש מכיוון שתרכובות מסוג זה קיימות מיליוני שנים ולכן התאפשרה התפתחות אבולוציונית טבעית של מנגנוני הפירוק המתאימים.

מוצרי פוליאתילן בר-פרוק - פתרון חלקי
בשנים האחרונית, עקב, דרישה גוברת בשוק, מתמקדים מחקרים רבים בפיתוח מוצרי פולימרים פריקים ביולוגית (Biodegradable), בעלי משך חיים קבוע וידוע מראש, בארבעה יעדים לפחות: חומרי אריזה, יריעות לחיפוי קרקע בחקלאות, אביזרים לשימוש חד פעמי במערכות אשפה וביוב, וביישומים רפואיים בהשתלות in vivo (Albertsson, 1980). עקב דרישות אלה פותחו מוצרי פיליאתילן המכונים מתכלים, משני סוגים עיקריים: פוליאתילן פריק ביולוגית ופוליאתילן פריק באור על ידי קרינת UV (UV Phorodegradable). החומר המכונה Biodegradable מכיל עמילן כפולימר נוסף הקשור לפוליאולפין, ואילו הפוליאתילן המכונה Photodegradable מכיל חומרים המגבירים פוטוליזה (UV Sensitizers). הפתרון של שני המוצרים האלה אינו מספק: במקרה של קופולימרים של עמילן-פוליאתילן אכן רכיב העמילן עובר פירוק, ולעתים גורם גם לאיבוד החוזק המכני של החומר מוקדם מהרצוי (Scott, 1990). בעוד שרכיב הפוליאתילן נותר שלם (Yabannavar and Bartha, 1994). פוטודגרדציה של פוליאתילן, המתכלה בקרינת UV מכילה תרכובת מתכתית המשמשת כקולטן UV (Photosensitizer), המתחיל תגובת שרשרת של רדיקלים חופשיים, המואצת באופן עצמאי. תגובת השרשרת גורמת לשבירת שרשרות הפולימר ולקבלת פרגמנטים קצרים, אשר בתנאים אירוביים יעברו חמצון לקבלת חומר פריך ושברירי בעל משקל מולקולרי נמוך, המתפורר לחתיכות קטנות. הפירוק המוחלט של הפולימר תלוי באסימילציה שלו על ידי מיקרואורגניזמים (Gilead, 1989), (התהליך מפורט בהמשך). אולם, בפוליאתילן זה הפוטוליזה השלמה נמשכת זמן רב ומחייבת חשיפה של הפלסטיק לאור. היות שחשיפה כזו לא תמיד ניתנת לביצוע עבור כל שטח הפלסטיק, באזורים שאינם חשופים לא יחול פירוק מלא. פיליאתילן זה מציב בעיה אקולוגית !וספת מכיוון שתרכובות קולטני ה-UV בחלק מהפולימרים הללו מבוססות על מתכות רעילות (כגון ניקל) הגורמות לזיהום סביבתי.


תמונה 2: צילום במיקרוסקופ אלקטרונים סורק (SEM) של הביופילם הנוצר על פני פוליאתילן לאחר 16 שעות הדגרה עם החיידק C208 במצע סינתטי, המכיל פוליאתילן כמקור פחמן יחיד (1000 X).


תמונה 3: צילום במיקרוסקופ אלקטרונים סורק (SEM) של הביופילם הנוצר על פני פוליאתילן לאחר 16 שעות הדגרה עם החיידק C208 במצע סינתטי, המכיל פוליאתילן כמקור פחמן יחיד (1000 X). ניתן לראות כי החיידקים שקועים בתוך הפוליאתילן. יתכן כי בשלב זה מתחילה פעולת הפירוק.


ביודגרדציה של פוליאתילן
פוליאתילן נחשב לפולימר עמיד ביותר בפני פירוק ביולוגי; במחקר על ביודגרדציה של פוליאתילן שהכיל פחמן מסומן (14C) ואשר הודגר (בתנאים מבוקרים) בקרקע למשך 10 שנים נמצא, כי כמנת ה-CO2 שהשתחררה מהפוליאתילן היתה נמוכה מ-0.2% על בסיס משקלי. (Albertsson & Karlsson, 1990).


תמונה 4: אכלוס פוליאתילן בביופילם של החיידק C208 במצע נוזלי המכיל 0.01% שמן מינרלי.


שינויים בפוליאתילן עקב פעילות החיידקים
כאמור, דוגמאות הפוליאתילן שעברו תהליך של ביודגרדציה הוקרנו תחילה ב-UV על מנת לגרום לפוטוליזה חלקית של הפולימר כטיפול מוקדם ליישום החיידקים. במטרה לבחון את השינויים החלים בפוליאתילן לאחר ההקרנה ב-UV ולאחר ההדגרה עם החיידקים - נבדקה הספקטרה האינפרה אדום (IR) לפני ההקרנה ואחריה ולאחר הטיפול עם החיידקים והסרת הביופילם. השיניי העיקרי החל בפוליאתילן עקב ההקרנה ב-UV הוא פוטואוקסידציה, המגבירה את ההידרופיליות של הפולימר על ידי יצירת שיירי קרבוניל הניתנים לניצול על ידי החיידקים. כצפוי, ספקטרום IR של פוליאתילן אשר לא הוקרן ב-UV לא הכיל שיירי קרבוניל. לאחר ההקרנה ב-UV מתקבל שיא בליעה ב-IR האופייני לקבוצות קרבוניליות (אורך גל 1718 cm-1). ריכוז קבוצות הקרבוניל עולה ביחס ישר למשך ההקרנה ב-UV. הדגרת פוליאתילן אשר הוקרן ב-UV עם חיידקים מסוג Bacillus (אשר בודדו לאחרונה) למשן 60 או 90 יום - הביאה לירידה בשיא ה-IR של קבוצות הקרבוניל.


איור 2: ספקטרום אינפרה אדום של פוליאתילן אשר הוקרן ב-UV למשך 120 שעות ואחר-כך הודגר עם חיידקי bacillus.


מנגנון הפירוק של פוליאתילן כולל שלב ראשוני חיוני, כנראה אביוטי, של פוטואוקסידציה, המגדילה את כמות החומר הנמוך מולקולרי (על ידי שבירת קשרים), כמו כן הפוטיואוקסידציה מגדילה את מידת ההידרופיליות של הפוליאתילן על ידי הכנסת קבוצות קרבוניל (Albertsson, 1993). באיור 3 מתואר המנגנון המקובל לפוטואוקסידציה של פוליאתילן.

איור 3: פוטואוקסידציה של פוליאתילן לפי Schlegel (1976). (במסגרת מופיע מספר גל אופייני של בליעה ב-IR.)



איור 4: מנגנון פוטודגרדציה מסוג Norrish 1 ו-Norrish 2 (לפי Vink, 1983). (במסגרת בליעה אופיינית ב-IR.)


התהליך מתחיל בקרינת UV המובילה ליצירת רדיקלים חופשיים. עם בליעת חמצן נוצרים הידרופראוקסידים, כאשר התוצרים הסופיים הם קבוצות קרבוניל. חשיפה נוספת לקרינת UV יכולה לגרום לקבוצות הקרבוניל לעבור פירוק מסוג Norrish 1 או 2 Norrish (איור 4) ואז יופיעו קבוצות נוספות הכוללות קשרים כפולים ואסטרים (Albertsson et al., 1987 ). סיכום
בעבודה זו בודדו חיידקי קרקע בעלי כושר לפירוק יריעות פוליאתילן בעלות צפיפות נמוכה (LDPE). הבידוד נעשה על ידי גידול התרביות במצע סינתטי מינימלי, כאשר הפוליאתילן היווה מקור פחמן יחיד. מידת הפירוק של חלק מדוגמאות הפוליאתילן שנמדדה לאחר כ-4 שבועות, הגיעה עד 15% משקלי. החיידקים המפרקים יוצרים ביופילם על פני הפוליאתילן, ובכך מתאפשר פירוקו.

בניסיון לשפר את הפירוק באמצעות שיפור אכלוס הפוליאתילן על ידי החיידקים, נבדקה תוספת משטחים אניוניים למצע הגידול. תוספת המשטחים לא הביאה לשיפור המיוחל בפירוק.

מידת ההידרופיביות של מספר תבדידי חיידקים הוערכה בשתי שיטות שונות, אשר נתנו אותן התוצאות. נמצא, כי התבדידים הידרופוביים אך במידה שונה. התבדיד ההידרופובי ביותר, C208, גדל היטב על שמן מינרלי כמקור פחמן יחיד (2% v/v). תוספת של שמן מינרלי לתרביות החיידקים הגבירה את האינטראקציות ההידרופוביות בין החיידקים לבין הפוליאתילן ושיפרה את אכלוס שטח פני הפוליאתילן על ידי הביופילם החיידקי.

הקרנת הפוליאתילן ב-UV גרמה לעלייה בריכוז קבוצות הקרבוניל והוויניל הטרמינלי בפולימר, ולאחר ההדגרה עם החיידקים נצפתה ירידה בריכוז שתי הקבוצות האלה שנבעה מביודגרדציה. יישום מוצלח של חיידקים כגון אלו שצוינו בעבודה זו לפירוק יעיל של פסולת פוליאתילן, יהיה תלוי רבות בפענוח מנגנון הפירוק ובפיתוח שיטות יישום מתאימות.


רשימת ספרות

1) Albertsson, A.C. Eur. Polym. J., 16: 623, ( 1980).
2) Albertsson, A.C. and Karlsson, S. Prog. Polym. Sci., 15: 177-192, (1990).
3) Aminabhavi, T.M., Balundgi, R.H, and Cassidy, P.E. Polym. Plast. Technol. Eng. 29: 235-262 (1990).
4) Gilead, D. (1989), In: Degradable Materials- perspectives, Issues and Opportunities: Barenberg, S.A., Brash, J.L.,Narayan, R., and Redpath, A.E. (Eds.) (1990).
5) Otake, Y., Kobayashi, T., Asabe, H., Murakarni, N., and Ono, K. J. Appl. Polym. Sci., 56; 1789-1796, (1995).
6) Potts, J.E., Biodegradation, In: Degradation and Stabilization of Polymers, H.H.G. Jellinek (Ed.), (1978).
7) Scott, G. In: Degradable Materials-perspectives, Issues and Opportunities, Barenberg, S.A., Brash, J.L. ,Narayan, R., and Redpath, A.E. (Eds.) (1990).
8) Swift, G. Ace. Chem. Res., 26: 105-110, (1993).
9) Yabannavar, A.V., and Bartha, R. Appl. Environ. Microbiol., 60: 3608-3614, (1994).

שותפים למחקר: עירית גילן (אור), ד"ר ולנטינה פבלוב.

 המכון למחקר יישומי במדעי החיים והמחלקה להנדסת ביוטכנולוגיה, אוניברסיטת בן גוריון בנגב 


 פורסם ב"כימיה", הוצאת "מדיום" גליון 57, 2001

יום רביעי, 5 בספטמבר 2001

מלחמת החיידקים - משבשים את הקשר - מאיה שולדינר


כל מי שצפה בסדרת הטלוויזיה המצוירת הידועה, "החיים", זוכר את מראה החיידקים "הרעים" המתכוננים לקרב. מפקדם עומד בראש, ובקול צפצפני מארגן את פלוגותיו למתקפה על גופנו. כששודרה הסדרה היתה סצינה זו פרי דמיונם של יוצריה בלבד, אך כיום הולך ומתבהר שגם חיידקים, כמו יצורים רב-תאיים, מתקשרים בינם ובין עצמם ו"מתאמים עמדות"...

ממחקרים שנערכו בשנים האחרונות בתחום התקשורת שבין חיידקים התברר כי כל חיידק מפריש חומרים הנקלטים על-ידי שכניו החיידקים. אחד החומרים שנחקרו הוא המולקולה הלקטונית הקטנה אה"ל (AHL - אציל-הומוסרין-לקטון). חומר זה משמש לחיידקים כאמצעי חישה של צפיפות האוכלוסייה באזור המחיה. אה"ל משרה שינוי בביטוי גנים בחיידקים וכך משפיע על פעילותם. התברר, למרבה ההפתעה, כי בחיידקים אלימים (פתוגניים) רבים התוקפים בני אדם, חיות או צמחים. מידע אודות הצפיפות בצורת אותות של אה"ל או חומרים אחרים, מפעיל את הגנים האחראים על תכונות האלימות של החיידקים ובניית "חלבוני תקיפה". כשצפיפות החיידקים נמוכה מרמה מסוימת, "מעדיפים" החיידקים שלא לעורר את מערכת החיסון, אך כאשר הם חשים גיבוי מצד הרבה "חבר'ה" שלהם, פותחים החיידקים במתקפה.

Y tambe, Wikimedia commons


צוות חוקרים בראשות ליאן-הוי ז'נג (Zhang) מאוניברסיטת סינגפור הציע ביוני בכתב העת Nature כיצד לנצל תופעה זו כדי להילחם בחיידקים אלימים. זה לא מכבר מצאו החוקרים כי בסוג אלים של חיידקי Bacillus קיים גן שמקודד בניית חלבון הפועל כאנזים המפרק את מולקולת האותות אה"ל (ייתכן כי אנזים מפרק זה מסייע לחיידק למחזר מולקולות שאיננו צריך). החוקרים הניחו שאם יגרמו לצמח מסויים לייצר את האנזים, יתפרק בסביבת הצמח החומר הפועל כאות כימי של החיידקים, וכל חיידק יתפקד כאילו הוא חיידק יחיד, "בודד במערכה", אף שלמעשה נמצאים בקרבתו מיליוני חיידקים נוספים. החיידק ה"חש בדידות" לא יפעיל את "חלבוני התקיפה" שלו, וכך יינצל הצמח ממחלה קשה. ואכן כאשר יצרה קבוצתו של ז'נג צמחים טרנסגניים - צמחים הנושאים את הגן לאנזים המפרק, וניסתה להדביקם בחיידק אלים הגורם לרקב, גילו הצמחים עמידות גבוהה.

ייתכן כי שיטה זו לחיסול מתקפות של חיידקים אלימים תהיה ישימה גם בבני אדם. חיידק Pseudomonas, הגורם למחלת ריאות קשה בבני אדם, משתמש גם הוא באותות כימיים לחישה של צפיפות האוכלוסין. החוקרים מציעים כי שימוש באנזים המפרק - או בחומרים החוסמים את פעילותו של החומר אה"ל - יתגלה בעתיד כנשק יעיל ללוחמה במחלה קשה זו.

פורסם ב"גליליאו" גיליון 47, ספטמבר 2001.